Значить, так

1) Террано дизельный даже на 33 колесах вполне себе едет. Не ракета, но едет. Дело у тебя не в коробке. Смотри - может, все остальное в совокупности машину за хвост держит. На 33х12.5 гудричах у меня дизельный террано, груженый 5 телами и барахлом на 10 дней, ехал в подъем в Мотах от 40 до 80 - как тапку давить. Грелся, но это другой вопрос. Главное, что ехал.
2) 31 дюйм - это стандарт для бензина и на 2 дюйма выше стандарта для дизеля. 31 резина влазит в машину без лифта! О какой потере динамики мы говорим?

3) Путь тебе лежит на terranoirk.ru, и там в поиск форума. Искать самому на работе некогда, и немного лень

но там есть темы с полной разблюдовкой всех потребных работ, запчастей, инструмента и прочего. И даже с картинками. Полное руководство по свапу АКПП-МКПП
4) Там же найдешь в форуме МКПП, там же продашь АКПП. Раздатка такая же.
5) Нюансы все в теме по свапу, они есть, но их не очень много.
6) Я бы пошел или к Мише Mikkenen (на этом форуме), или к "Пилигримам". А если машина не на повседневку (или есть отпуск), в наличии гараж и несколько дней времени, то можно и самому, там ничего не надо пилить-варить-болгарить.